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7 mars 2024 · To tackle these problems, we propose a protein folding framework called SGNet to model protein-protein interactions in symmetrical assemblies. SGNet conducts feature extraction on a single subunit and generates the whole assembly using our proposed symmetry module, which largely mitigates computational problems caused by sequence length.
Instructions. You can run the model with the script run_squad.sh and run_race.sh. We upload the processed example data in data folder which is annotated by our dependency labeler for quick practice. The labeler model is the HPSG-Neural-Parser. The implementation for this work will be publicly available soon.
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